Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
FAM3DQ96BQ1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms