Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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