Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNXAQ16473 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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