Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
E2F4Q16254 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms