Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SEC23AQ15436 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC23AQ15436 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms