Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PCOLCEQ15113 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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