Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NCAPHQ15003 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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NCAPHQ15003 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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NCAPHQ15003 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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NCAPHQ15003 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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NCAPHQ15003 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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NCAPHQ15003 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NCAPHQ15003 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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