Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CSHL1Q14406 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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