Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARF1Q14162 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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