Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UBE4AQ14139 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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