Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A3Q14050 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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