Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms