Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF2H2Q13888 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms