Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SPTAN1Q13813 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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