Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FHL3Q13643 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms