Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL4AQ13619 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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