Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PEX6Q13608 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms