Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SNX1Q13596 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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