Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
MSLNQ13421 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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