Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SP140Q13342 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SP140Q13342 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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