Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms