Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CALCOCO2Q13137 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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