Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1AQ13111 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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