Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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TRAF1Q13077 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF1Q13077 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TRAF1Q13077 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRAF1Q13077 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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