Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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