Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNEQ04844 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms