Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PGGT1BP53609 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PGGT1BP53609 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PGGT1BP53609 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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