Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
J3KRW8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
J3KRW8 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
J3KRW8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
J3KRW8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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