Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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