Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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HDGFL3Q9Y3E1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HDGFL3Q9Y3E1 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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