Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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USP18Q9UMW8 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP18Q9UMW8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
USP18Q9UMW8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USP18Q9UMW8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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