Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FAM53CQ9NYF3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms