Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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LHX9Q9NQ69 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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LHX9Q9NQ69 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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LHX9Q9NQ69 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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