Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TOP1MTQ969P6 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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TOP1MTQ969P6 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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TOP1MTQ969P6 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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