Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SMIM5Q71RC9 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SMIM5Q71RC9 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms