Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM187BQ17R55 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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FAM187BQ17R55 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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FAM187BQ17R55 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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