Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RTN1Q16799 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RTN1Q16799 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms