Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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ME3Q16798 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ME3Q16798 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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ME3Q16798 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ME3Q16798 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ME3Q16798 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ME3Q16798 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ME3Q16798 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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ME3Q16798 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ME3Q16798 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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