Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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