Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC18A3Q16572 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC18A3Q16572 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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