Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NCOA1Q15788 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NCOA1Q15788 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms