Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PDGFRLQ15198 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDGFRLQ15198 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms