Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
BRD3Q15059 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms