| BRD3 | Q15059 | AC107393.1-201 | ENST00000512403 | 346 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-988P-201 | ENST00000519081 | 107 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC110588.1-201 | ENST00000559699 | 137 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC124312.5-201 | ENST00000604451 | 268 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP001485.1-201 | ENST00000604799 | 199 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL121890.5-201 | ENST00000620848 | 304 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | LRRD1-203 | ENST00000430130 | 2661 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | FSD1L-201 | ENST00000374707 | 7062 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-21P-201 | ENST00000384710 | 107 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR548P-201 | ENST00000408336 | 84 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-30P-201 | ENST00000410245 | 143 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-710P-201 | ENST00000410424 | 105 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNX2P2-201 | ENST00000424553 | 323 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO2P12-201 | ENST00000427426 | 682 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-970P-201 | ENST00000516312 | 107 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP168-201 | ENST00000516642 | 112 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022616.4-201 | ENST00000522985 | 181 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | DLX6-AS1_2.1-201 | ENST00000613701 | 207 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | OSBPL1A-217 | ENST00000638614 | 84 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD81.1-201 | ENST00000363064 | 77 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA63.7-201 | ENST00000365579 | 123 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | U8.16-201 | ENST00000391279 | 133 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC126177.2-201 | ENST00000552154 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4778-201 | ENST00000577635 | 80 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008781.2-201 | ENST00000502205 | 2480 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011604.2-202 | ENST00000540229 | 2451 nt | APPRIS P5 TSL 2 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-41P-201 | ENST00000364426 | 143 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-450P-201 | ENST00000364654 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-823P-201 | ENST00000391042 | 103 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-855P-201 | ENST00000410395 | 104 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS20P10-201 | ENST00000451209 | 253 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.715-201 | ENST00000517082 | 110 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC015818.4-201 | ENST00000580931 | 353 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB117-201 | ENST00000602356 | 141 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL078604.3-201 | ENST00000615580 | 211 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | KIAA1107-201 | ENST00000370378 | 4622 nt | TSL 5 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF355P-201 | ENST00000427301 | 3216 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-76P-201 | ENST00000364509 | 141 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA22B-201 | ENST00000383876 | 138 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1080P-201 | ENST00000383982 | 107 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR1289-2-201 | ENST00000408360 | 111 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.621-201 | ENST00000411065 | 96 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.711-201 | ENST00000516993 | 102 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011604.1-201 | ENST00000545978 | 196 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC136932.1-201 | ENST00000574771 | 208 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC104695.3-201 | ENST00000604052 | 296 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01378-205 | ENST00000615833 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC106754.2-201 | ENST00000623006 | 233 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR583-201 | ENST00000384846 | 75 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-101P-201 | ENST00000410323 | 104 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL30P13-201 | ENST00000418873 | 348 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL135790.2-201 | ENST00000437701 | 267 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z98949.2-201 | ENST00000440996 | 144 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | snoU13.26-201 | ENST00000459452 | 105 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL39P38-201 | ENST00000467018 | 153 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092991.1-201 | ENST00000477176 | 376 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-397P-201 | ENST00000516226 | 104 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1046P-201 | ENST00000516538 | 107 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.721-201 | ENST00000517207 | 102 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005972.2-201 | ENST00000604690 | 348 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | ASPM-202 | ENST00000367408 | 3747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIRLET7C-201 | ENST00000362160 | 84 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.389-201 | ENST00000383924 | 113 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-98P-201 | ENST00000458992 | 160 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | snoU13.15-201 | ENST00000459407 | 104 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090124.1-201 | ENST00000525097 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL512310.8-201 | ENST00000550183 | 120 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAC1P9-201 | ENST00000604990 | 392 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-199P-201 | ENST00000362954 | 107 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590004.1-201 | ENST00000405321 | 300 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR1252-201 | ENST00000408861 | 65 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC024067.1-201 | ENST00000426199 | 223 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010655.3-201 | ENST00000478818 | 450 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS29P11-201 | ENST00000496507 | 171 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU7-12P-201 | ENST00000516030 | 62 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC100807.1-201 | ENST00000517640 | 552 nt | TSL 5 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3145-201 | ENST00000580727 | 82 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD113-5-201 | ENST00000607261 | 78 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | TP73-AS1.1-201 | ENST00000611447 | 161 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR8081-201 | ENST00000611533 | 95 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR376A1-201 | ENST00000616574 | 68 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | ABCA9-AS1-203 | ENST00000627596 | 426 nt | TSL 5 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | TPTE2-204 | ENST00000400103 | 1652 nt | TSL 5 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | SKIL-204 | ENST00000458537 | 7182 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.310-201 | ENST00000365063 | 113 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.341-201 | ENST00000365341 | 102 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.368-201 | ENST00000365547 | 113 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | SEPT14P8-201 | ENST00000508026 | 178 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC020661.2-201 | ENST00000560114 | 134 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4300-201 | ENST00000581016 | 96 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR3171-201 | ENST00000584270 | 74 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| BRD3 | Q15059 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD68-201 | ENST00000363214 | 84 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.286-201 | ENST00000364813 | 102 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.456-201 | ENST00000384232 | 111 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA72-201 | ENST00000384339 | 132 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-997P-201 | ENST00000384725 | 107 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR9-3-201 | ENST00000385084 | 90 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |