Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHPRHQ149N8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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