Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMC1AQ14683 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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