Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTCH1Q13635 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTCH1Q13635 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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