Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PEX6Q13608 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PEX6Q13608 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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