Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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SNX1Q13596 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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SNX1Q13596 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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SNX1Q13596 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SNX1Q13596 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SNX1Q13596 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SNX1Q13596 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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