Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD4Q13485 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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