Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
XRCC4Q13426 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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